Der Grundsatz eines Landschaftspflegeverbandes ist das gleichberechtigte Miteinander von Land- und Forstwirtschaft, Kommunen bzw. Landkreis und Naturschutzverbänden bei der Umsetzung der Verbandsaufgaben. Dementsprechend setzt sich auch der Vorstand des Landschaftspflegeverbands Main-Spessart e.V. mit der sogenannten Drittelparität zusammen: Sowohl die drei Vorsitzenden als auch ihre BeisitzerInnen kommen zu gleichen Teilen aus (Kommunal-)politik, Landwirtschaft und Naturschutz. 1. Vorsitzende ist die Landrätin Sabine Sitter. Der Vorstand arbeitet ehrenamtlich.

Fachliche Unterstützung erhält der Vorstand durch den Fachbeirat. Er besteht aus VertreterInnen der Unteren Naturschutzbehörde des Landkreises, des Amtes für Ernährung, Landwirtschaft und Forsten in Karlstadt und des Wasserwirtschaftsamtes Aschaffenburg.